在特朗普政府表示将冻结超过20亿美元的联邦拨款和合同大约24小时后，哈佛大学的研究机构开始评估这一举措带来的影响。
哈佛大学负责研究事务的副教务长John Shaw在周二晚上给同事们发了电子邮件，要求他们一旦发现任何资金中断的情况，就通知赞助项目办公室，并告知应该采取哪些措施。
根据另一封电子邮件，哈佛大学文理学院（哈佛大学本科和博士项目所在学院）的教授们收到通知，称未来几天将安排一次全体教师大会来解答疑问。
资金冻结对哈佛大学来说，可能会威胁到多达90亿美元的联邦资金。除了失去这些资金带来的实际影响外，目前还不清楚这场僵局会发展到何种程度。
一位未获授权公开发言的哈佛大学教授表示：“联邦政府对这所大学的干预程度，有时很明显，有时又不那么明显。他们正在针对每个学院可能发生的情况做大量的情景规划。”
在对资金问题感到担忧之际，美国国土安全部周三威胁哈佛大学，如果该校不满足联邦政府的要求，将取消其招收国际学生的资格。国土安全部部长Kristi Noem要求哈佛大学在4月30日前提供有关国际学生所谓“非法和暴力活动”的记录，否则就有可能失去其“学生和交流访问者项目”认证，而这一认证能让高等教育机构为非移民学生签证发放资格证书。
据两位知情人士透露，这位教授表达的其他担忧还包括哈佛大学可能会失去免税资格，美国国税局正计划取消该校的这一资格；此外，联邦政府可能会决定停止向外国学生发放签证，而外国学生占哈佛大学学生总数的四分之一以上。
哈佛大学经济学教授Gregory Mankiw说：“我甚至不确定失去免税资格意味着什么。我们没有股东，也不分红，所以我不确定会产生什么后果。”“我们不清楚将如何被征税。”
据报道，从免税政策中受益的非营利组织如果违反多项规定（包括政治活动方面的规定），就可能失去免税资格。美国国税局取消免税资格是极为罕见的举措。几十年前，美国国税局曾以歧视为由取消了一所基督教大学的免税资格。
消息人士称，预计很快就会做出是否取消哈佛大学免税资格的最终决定。
哈佛大学532亿美元的捐赠基金可能是另一个令人担忧的领域。共和党众议员Mike Lawler最近提出的一项立法，将把捐赠基金收入的税率从1.4%提高到10%。
Mankiw表示：“如果这项税收政策实施，那就意味着学校将不得不削减某些方面的开支。”他说：“我们的工作是教学和研究。问题就变成了：减少研究或减少教学，对社会来说哪个更好呢？这所学校将面临很多艰难的抉择。”
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