两个菠菜野生种高质量基因组序列发布
中国科学报
菠菜野生种Spinacia turkestanica。
本报讯(记者李晨 通讯员陈旭)近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所研究员钱伟团队揭示了菠菜的染色体结构,解析其重要的驯化性状,同时在《新植物学家》在线发表了两个高质量的菠菜野生种基因组序列。
菠菜又名波斯草、赤根菜,于唐代作为尼泊尔的贡品传入我国。菠菜有两种不同类型的野生种——S. turkestanica和S. tetrandra。野生材料往往具有较强的适应性和抗逆境能力,因此是作物遗传改良的重要资源。而菠菜的两种野生型基因组信息尚不清楚,阻碍了菠菜野生种的进一步利用。因此,解析菠菜野生种基因组序列,挖掘重要的驯化性状相关基因,才能为培育优质菠菜品种奠定基础。
该研究从头组装了两个高质量的菠菜野生种基因组序列,并解析其基因组近着丝粒区域特征。研究还证实了S. turkestanica野生种为栽培种的直接祖先,二者大约在0.8百万年前分化;而S. tetrandra与其分化的时间更久,大约在6.3百万年前分化。
此外,研究发现栽培种的抗霜霉病位点由野生种渐渗而来,同时挖掘出大量与驯化相关的基因,其主要与光周期、抗逆、抗病等相关。该研究对进一步利用菠菜野生资源,培育优质菠菜品种具有理论指导作用。
相关论文信息:
https://doi.org/10.1111/nph.19799