5000个AI设计蛋白将接受实验检验,“长江杯”全球挑战赛启动
(来源:上观新闻)
一个由AI设计出的蛋白质,能否真正被合成、稳定表达并实现预期功能,最终仍要走进实验室接受检验。近日,“长江杯”2026全球AI蛋白质设计挑战赛启动,赛事将湿实验验证纳入核心评价环节,对统一筛选后的不少于5000个AI设计候选蛋白,免费开展表达、纯化和检测,以真实实验结果评选优胜方案。
蛋白质承担着催化、识别、信号传递等大量生命功能,其性能很大程度上由氨基酸序列决定。一条仅100个氨基酸组成的蛋白质,理论上的序列组合就高达 20的100次方种,靠传统设计方法难以完成,AI能够从海量数据中学习序列、结构与功能规律,更快找到有潜力的候选设计。以上海交通大学洪亮教授团队构建的全球最大的蛋白质数据集Venus-Pod为例,该数据集包含数百亿条序列、几十亿个功能标签。这些序列不仅涵盖了常规生物,还包括从马里亚纳海沟、火山口等极端环境中采集的耐高温、耐强压、耐强酸/强碱的蛋白质,几乎囊括了自然界所有的蛋白语料,是Venus 模型创造蛋白质的“工具箱”——基于此数据集训练的 Venus 模型,能够快速高效地优化改造蛋白质,满足各种产业需求。
比赛将设置多个设计靶点,主要考查纳米抗体和迷你结合蛋白的从头设计。纳米抗体可以理解为体积更小的抗体功能单元,在药物和诊断领域具有应用价值;迷你结合蛋白则由算法从零设计,用于检验AI生成自然界中不存在的新蛋白质的能力。
组委会将以统一实验流程检验不同团队、模型和技术路线,并沉淀实验数据,用于算法比较、模型迭代和AI蛋白质设计评价基准建设。赛事由此探索“AI提出设计、实验进行验证、数据返回模型”的科研闭环,减少只在计算环境中评价算法带来的偏差。
比赛由上海交通大学、上海人工智能实验室、临港实验室、昌平实验室、香港中文大学、浙江大学、上海科学智能研究院等十余家机构共同参与,在上海市经济和信息化委员会、上海市科学技术委员会指导下举办。
大赛面向全球高校、科研院所、企业及跨学科团队开放,鼓励人工智能、计算生物学、结构生物学和蛋白质工程研究者联合参赛,奖金总额为100万元。参赛信息可登录https://aiprotein.sjtu.edu.cn/查询。
原标题:《5000个AI设计蛋白将接受实验检验,“长江杯”全球挑战赛启动》