近年来，由于欧盟和日本先后实施了新的食品安全法规标准，不断抬高番茄制品进入国际市场的门槛。面对欧美国家更加挑剔的目光，中国一些番茄加工业企业开始联合起来抵制农药超标的番茄。
虽然新疆出产世界上最好的番茄，但农药残留和霉菌超标曾是中国产番茄酱参与国际竞争落败的致命原因，这一度使陶醉在低成本优势中的中国番茄企业面临整体“下课”的危局。在不断增高的“绿色壁垒”前，新疆出产的番茄酱频频碰壁，出口量锐减。由于出口受挫，企业无法兑付农民的原料款，新疆农民种植番茄的热情也急剧下降，种植面积一度缩减到80万亩以下。
作为国际市场上的竞争对手，我国番茄加工业两大巨头新疆中基公司和中粮屯河公司从去年起，联合抵制农药超标的番茄原料进入加工流程，并互相通报生产不合格番茄的农户名单，通过电视和广播予以公布，使农民提高原料安全管理的意识。新中基公司还引进世界最先进的农药残留物检测设备，有了这种设备，只需摘下一片叶子，就能检测出田里番茄的农药含量。
在中国企业这种近乎苛刻的要求下，新疆数万农民种出了世界上品质最好的番茄。而企业从“源头”做起，让这一重要出口产品重新拿到了进入国际市场的通行证，使新疆成为我国最大的加工番茄种植区域。新疆以番茄加工业为主的 “红色产业” 也得到世界同行认可，出口产品在国际市场上的“话语权”不断加强，重新夺回一度失去的国际市场，新疆番茄种植面积也恢复到近百万亩的规模，番茄加工量也达到近400万吨，占全国总量的90％，使中国成为全球番茄产业第三大生产国。
在开拓市场的竞争中，一些企业利用低价策略，迫使其他企业降低成本维持微薄效益，结果优势化解，出口“量增价跌”，新疆大多数番茄加工企业一度也因此普遍亏损。国内企业“自相残杀”也给境外企业可乘之机，一些国外客户两边压价，更使中国企业雪上加霜。亨氏、联合利华等国外厂商则把中国企业初加工的“大包装番茄酱”换成小包装，再贴上自己的商标进行销售，获得丰厚利润；而中国企业则由于效益滑坡，资金难以回笼。在“内战”中伤痕累累的中国番茄加工企业，逐步把目光转向调整产品结构和加强质量管理，部分实力较强的企业不再满足为国外企业提供原料，开始尝试进入高端市场。小包装番茄、“番茄粉”、“番茄红素”等高附加值产品的开发，极大地拉长了新疆的红色产业链，增强了我国企业在国际市场上的“话语权”，新疆番茄酱出口量约占全球番茄酱贸易总量的四分之一。
由于我国劳动力和农业生产资料价格不断上涨，使红色产业也面临着前所未有的“成本危机”。目前，我国首次大规模机械化采收番茄在新疆已经得到实现，往日人头攒动的采摘场景已不复存在。在上千亩的番茄地里，只有一台采摘机在往复工作，一个个鲜红的番茄不断从采摘机中滑入随行的卡车车厢。往年至少400人的工作，今年只需一台采收机就可以胜任，极大地降低了采收成本。采出的番茄不仅杂质少，还减少了被污染的可能。经过数年引进试验和科研开发，新疆机械采摘番茄的各项技术已趋于成熟，从栽种、田间管理到采收，已形成一套较为成熟的模式。
