2003年12月，嘉兴市委、市政府决定设立嘉兴市国有资产监督管理委员会。嘉兴市国资委、嘉兴市经济体制改革办公室、嘉兴市委企工委合署办公，实行三块牌子，一套班子。
2005年5月，根据嘉兴市委、市政府《关于嘉兴市人民政府国有资产监督管理委员会职能配置、内设机构和人员编制调整的通知》精神，嘉兴市经济体制改革办公室承担的部分职能划入市发改委，并予以撤销，至10月底，人员、资产等移交工作已全面结束，嘉兴市国资委机构改革顺利完成。
调整后的嘉兴市国资委编制28人，下设八个职能处室，即办公室、财务监管处、资产监管处、业绩考核处、企业上市与发展处、人事处、组织宣传处、纪工委（监察室）。
