原标题：贝瑞基因三代测序平衡易位断裂点检测研究成果荣登Fertility and Sterility 来源：同花顺
近日，贝瑞基因联合解放军总医院在妇产科著名杂志 Fertility and Sterility上发表了《Variant haplophasing by long-read sequencing: a new approach to preimplantation genetic testing workups》的文章。
本研究创新性地将三代测序技术应用于辅助生殖领域，成功检出参与试验的15名平衡易位携带者的精准断裂点，最终成功地帮助3对欲进行 PGT-SR（ 胚胎植入前染色体结构变异遗传学检测）的夫妇获得了核型正常的胎儿。
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研究目的
建立一种借助三代测序技术进行PGT-SR和PGT-M（胚胎植入前单基因病遗传学检测）的方法。
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研究方法
本研究采用三代测序技术获得平衡易位携带者的精准断裂点信息，并基于连锁SNP位点构建精准单体型，最后进行PGT-SR和PGT-M。
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研究结果
平衡易位断裂点检出率100%
本研究通过三代测序平衡易位断裂点检测，成功地检出参与试验的15名平衡易位携带者的精准断裂点（见下表）。在所有检出的30个断裂点中，有15个位于基因间区，有11个位于基因内区域，剩余4个位于已知的RNA调控区域内。
表1 平衡易位断裂点检测结果图
图1 平衡易位断裂点在基因组上的位置分布
PGT-SR
参与本研究的15对夫妇中有3对夫妇进行了PGT-SR，涉及到的染色体平衡易位分别为t(1; 17)(q21; p13)，t(3; 13)(p25; q21.2)和t(12; 13)(q23; q22)。
以平衡易位携带者t(1;17)(q21;p13)为例，本研究通过连锁SNP位点构建了断裂点附近的精准单体型（见图2），该信息主要用于推断平衡易位携带胚胎和正常胚胎的基因型。体外受精后，通过胚胎植入前非整倍体遗传学检测（PGT-A）筛选出3个整倍体胚胎（包括正常胚胎和平衡易位携带胚胎），然后再通过PGT-SR筛选出不携带平衡易位的E10胚胎并进行植入。
最终，产前诊断结果证实胎儿核型正常。通过使用该策略本研究成功地帮助3对夫妇获得了核型正常的胎儿。
图2 t(1; 17)(q21; p13)携带者断裂点附近的单体型结果
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研究结论
对于欲借助PGT（胚胎植入前遗传学检测）进行辅助生殖的夫妇，通过三代测序平衡易位断裂点检测获得精准断裂点和连锁SNP位点，最终可构建出断裂点附近的精准单体型并用于PGT-SR，以帮助平衡易位的夫妇获得核型正常的胎儿。
三代测序平衡易位断裂点检测
贝瑞基因开创性应用三代测序技术，通过单分子超长读长（30kb-100kb）测序，可检出包括基因组复杂区域（高GC、高重复和假基因区域等）在内的全基因组范围内的平衡易位断裂点，并将断裂点定位至单碱基水平；同时基于连锁SNP构建精准单体型，从而准确区分平衡易位胚胎与正常胚胎，精准阻断染色体平衡易位向子代传递。
出生缺陷的综合防治之路任重道远，贝瑞基因一直在创新与探索。三代测序平衡易位断裂点检测将进一步推动高通量测序技术在出生缺陷防控领域的应用和发展，助力临床更经济高效地开展相关检测，辅助医生为患者提供更专业、更放心的检测服务。
参考文献：
M M YC, Yu Q, Ma M, Wang H, Tian S, Zhang W, M M JZ, Liu Y, Yang Q, pan X,Liang H, Wang L, Leigh D, Cram DS, Yao Y. Variant haplophasing by long-readsequencing: a new approach to preimplantation genetic testing workups. FertilSteril. 2021 May 18:S0015-0282(21)00297-1. doi:10.1016/j.fertnstert.2021.04.012. Epub ahead of print. PMID: 34020778.
